Tên chuyên đề: Nghiên cứu căn nguyên, kết quả điều trị và xác định đường lây truyền của các chủng vi khuẩn đa kháng thuốc gây viêm phổi liên quan đến thở máy bằng kỹ thuật giải trình tự gen thế hệ mới. (Ngày công bố: 26-01-2022)

Chuyên ngành: Truyền nhiễm và các bệnh nhiệt đới - 62720153

Họ tên: Trần Thị Hải Ninh

Ngày bảo vệ:

Hướng dẫn 1:GS.TS. Nguyễn Văn Kính

Hướng dẫn 2: PGS.TS. Nguyễn Vũ Trung

Tóm tắt tiếng việt:

Những kết luận mới của luận án:

1. Căn nguyên và đặc tính kháng kháng sinh của các chủng vi khuẩn gây viêm phổi liên quan thở máy

Căn nguyên gây viêm phổi liên quan thở máy gặp phổ biến là các vi khuẩn Gram âm, trong đó hàng đầu là A. baumanii, K. pneumonia và P. aeruginosa. Trong các vi khuẩn Gram dương, căn nguyên gặp nhiều nhất là S. aureus và cũng là căn nguyên thường gặp thứ 4. Ghi nhận sự đề kháng cao của các vi khuẩn với kháng sinh: > 80% các chủng  A. baumanii, K. pneumoniae, P. aeruginosa đã kháng với gần như tất cả kháng sinh được thử, trừ colistin.

2. Kết quả điều trị bệnh nhân viêm phổi liên quan thở máy

Tỷ lệ bệnh nhân tử vong hoặc xin về để tử vong là 36,18%. Thời gian nằm viện tương đối dài, trung bình là 28,0 ± 18,0 ngày. Điều trị kháng sinh ban đầu phù hợp ở 41,18% nhóm tử vong và 70,00% nhóm sống nhưng khác biệt giữa 2 nhóm không có ý nghĩa thống kê.

3. Xác định nguồn lây truyền của các vi khuẩn đa kháng thuốc bằng kỹ thuật giải trình tự gen thế hệ mới

Xác định được một số Sequence Types (STs) nổi trội, đặc trưng riêng tại địa điểm nghiên cứu: ST2 (48%),  ST571 (24%) của A. baumannii; ST15 (34%), ST16 (30%) của K. pneumoniae. Ghi nhận sự xuất hiện thường xuyên và các cụm lây truyền quy mô lớn, hầu hết có liên quan đến mẫu môi trường của A. baumannii (39 cụm lây truyền, liên quan từ 2 đến 22 chủng) và K. pneumoniae (37 cụm lây truyền, liên quan từ 2 đến 53 chủng). Tuy nhiên, E. coli chỉ xuất hiện ít và lây truyền hạn chế (11 cụm, liên quan từ 2 đến 6 chủng).

Tóm tắt tiếng anh:

Summary the new findings of the thesis:

1. Etiology and antibiotic resistance characteristics of bacterial causing ventilator-associated pneumonia

The most common causes of ventilator-associated pneumonia were Gram-negative bacteria, of which A. baumanii, K. pneumonia and P. aeruginosa were the leading causes. Among Gram-positive bacteria, the most common cause was S. aureus and also the 4th most common cause. High resistance of bacteria to antibiotics was recorded: > 80% of strains A. baumanii, K . pneumoniae, P. aeruginosa were resistant to nearly all tested antibiotics, except colistin.

2. Outcomes of ventilator-associated pneumonia patients

Mortality rate was 36,18%. Hospitalization was relatively long, average about 28,0 ± 18,0 days. Initial antibiotic treatment was appropriate in 41,18% patients of the mortality group and 70,00% patients of the survival group, but the difference between the two groups was not statistically significant.

3. Determine of the transmission source of multidrug-resistant bacteria by next-generation sequencing

Some outstanding Sequence Types (STs) were identified, unique to the study site: ST2 (48%), ST571 (24%) of A. baumannii; ST15 (34%), ST16 (30%) of K. pneumoniae. Frequent appearance and large-scale transmission clusters were noted, most of which were associated with environmental samples of A.baumannii (39 clusters, involving 2 to 22 strains) and K. pneumoniae (37 clusters, involving 2 and 53 strains). However, E. coli appeared infrequently and had limited transmission (11 clusters, involving 2 to 6 strains).

Tóm tắt: Tải file

Toàn văn: Tải file